Гибридизационные зонды (FRET зонды) -это зонды, работающие на механизме Фёрстеровской переносе энергии (FRET) от донора к акцептору (между хромофорами). Зонды FRET представляют собой олигонуклеотиды, содержащие в своем составе флуоресцентные красители, сближающиеся при гибридизации с мишенью. Флуорофоры подбираются таким образом, чтобы спектр испускания одного из них (донор) значительно перекрывался со спектром возбуждения другого флуорофора (акцептор). В этом случае при возбуждении флуорофора-донора энергия излучения передается флуорофору-акцептору через диполь-дипольное взаимодействиес последующим излучением света и регистрацией сигнала. Обычно FRET зонды - это пара олигонуклеотидов, один из которых несет 3’-донорный краситель, а другой — 5’-акцепторный краситель.
- Применение: ПЦР-РВ, ОТ-ПЦР-РВ, анализ количества копий ДНК, определение патогенов, генотипирование однонуклеотидных полиморфизмов.
- Мультиплексирование
- Различные варианты пар донор-акцептор
Рекомендованные FRET пары
Флуорофор | Гаситель |
ROX | FAM |
Cy5 |