Гибридизационные зонды (FRET зонды)

  • Гибридизационные зонды FRET состоят из двух олигонуклеотидов, содержащих флуоресцентно-меченые донорные и акцепторные красители (пара FRET), которые могут находиться в непосредственной близости только после связывания с мишенью. Без ДНК-мишени взаимодействие между зондами отсутствует, и прямое возбуждение акцепторного красителя невозможно, в то время как при связывании с мишенью можно наблюдать передачу энергии, поскольку красители становятся расположены в непосредственной близости. Если донорный флуорофор возбуждается внешним источником света, часть энергии возбуждения передается соседнему акцепторному флуорофору с последующим излучением.

Гибридизационные зонды (FRET зонды) -это зонды, работающие на механизме Фёрстеровской переносе энергии (FRET) от донора к акцептору (между хромофорами). Зонды FRET представляют собой олигонуклеотиды, содержащие в своем составе флуоресцентные красители, сближающиеся при гибридизации с мишенью. Флуорофоры подбираются таким образом, чтобы спектр испускания одного из них (донор) значительно перекрывался со спектром возбуждения другого флуорофора (акцептор). В этом случае при возбуждении флуорофора-донора энергия излучения передается флуорофору-акцептору через диполь-дипольное взаимодействиес последующим излучением света и регистрацией сигнала. Обычно FRET зонды - это пара олигонуклеотидов, один из которых несет 3’-донорный краситель, а другой — 5’-акцепторный краситель.

  • Применение: ПЦР-РВ, ОТ-ПЦР-РВ, анализ количества копий ДНК, определение патогенов,  генотипирование однонуклеотидных полиморфизмов.
  • Мультиплексирование
  • Различные варианты пар донор-акцептор 

Рекомендованные FRET пары

Флуорофор Гаситель
ROX FAM
Cy5